1. Koncentrácia pufra
Koncentrácia pufra TRIS môže ovplyvniť účinnosť a presnosť reakcie PCR. Vo všeobecnosti sú vhodné koncentrácie TRIS pufra medzi 10-100 mM. Ak je koncentrácia pufra príliš nízka, môže to viesť k nestabilnému pH reakčného systému, čo môže ovplyvniť účinnosť a presnosť reakcie PCR. Ak je koncentrácia tlmivého roztoku príliš vysoká, môže inhibovať aktivitu polymerázy, čo ovplyvňuje účinnosť a presnosť reakcie PCR.
2. pH pufra
pH TRIS pufra tiež ovplyvňuje účinnosť a presnosť PCR reakcie. Vo všeobecnosti je pH reakcie PCR medzi 8,0-8,8. Ak je pH tlmivého roztoku príliš nízke, môže to viesť k zníženiu aktivity polymerázy, čo môže ovplyvniť účinnosť a presnosť reakcie PCR. Ak je pH tlmivého roztoku príliš vysoké, môže to viesť k neúplnej denaturácii templátu DNA, čo môže ovplyvniť účinnosť a presnosť reakcie PCR.
3. Iónová sila pufra
Iónová sila TRIS pufra tiež ovplyvňuje účinnosť a presnosť PCR reakcie. Vo všeobecnosti je iónová sila TRIS pufra medzi 50-150 mM. Ak je iónová sila pufra príliš nízka, môže to viesť k nestabilným koncentráciám iónov v reakčnom systéme, čo môže ovplyvniť účinnosť a presnosť reakcie PCR. Ak je iónová sila pufra príliš vysoká, môže inhibovať aktivitu polymerázy, čo ovplyvňuje účinnosť a presnosť reakcie PCR.
